肿瘤基因检测技术具体应用在癌症治疗哪个方面?

本文作者: 2周前 (04-06)

肿瘤基因检测技术的应用,建立在实验技术之上,首先通过实验室检测出相应需求的数据,然后对基因数据进行解读。 治疗 […]

肿瘤基因检测技术的应用,建立在实验技术之上,首先通过实验室检测出相应需求的数据,然后对基因数据进行解读。

治疗癌症时,对肿瘤基因检测结果的解读与应用,主要体现在以下5方面:

  • 1、癌症早筛|肿瘤早期筛查
  • 2、癌症遗传|肿瘤易感基因检测
  • 3、靶向用药基因检测|靶向用药伴随诊断
  • 4、化疗药物疗效检测
  • 5、基因检测数据解读|用药参考

1、癌症早筛|肿瘤早期筛查

人体中的肿瘤癌细胞增殖、分裂、生长、发展是以指数速度进行的,早期发现的肿瘤隐患和晚期癌症预后有巨大的差别,生存机会天地之别,所以对癌症隐患的排查,是治疗癌症的重中之重,早发现,早治疗。

癌症早筛在技术方面的要求就是基因检测的灵敏度和特异性,其中灵敏度要求排在第一优先级。

在基因层面,肿瘤是各不相同的。肺癌和乳腺癌不同,肺癌和肺癌不同,同一个肺癌患者有在不同阶段也不同,同一个肺癌患者在同一阶段,不同的肿瘤细胞也不同。因为目前医学界和工程界仍然无法很好地解决肿瘤异质性的问题,目前还没有办法通过找到某个基因或某组基因目标,通过检测它,就能下结论说是已经发生癌症。所以临床上用于早期筛查的肿瘤基因检测项目,仍然是通过常规检查配合基因检测的方式在进行。

癌症早期筛查目前常规采样为外周静脉血。原理是如果身体中有隐匿的肿瘤病变组织,外周血当中存在游离的ctDNA,但如果属于早期病变,ctDNA含量可能极其微少而难以检出,需要

这就回到了另一个技术层面的难点,即使身体存在隐匿的肿瘤病灶,外周血当中ctDNA的含量可能是极其微少,导致难以检测出来。为了提高肿瘤检出率,必须使用专项样本,比如使用粪便样本,对消化系统肿瘤进行针对性检测,但对其他的肿瘤这个样本就没什么作用。

所以面对这样的限制条件,百配健康的建议是在45岁前后,可考虑以下5个方面的针对性项目检测。

  • (1)长期吸烟的男性,检测是否有肺癌隐患。
  • (2)长期喝酒的男性,检测是否有肝癌隐患。
  • (3)女性主要针对乳腺癌和卵巢癌进行针对性早筛。
  • (4)长期喝凉茶和爱吃补药的人群,可针对肾癌进行早筛。
  • (5)常吃辛辣/高温/腌腊制品的人群检测是否有咽喉、食道、胃肠等消化系统肿瘤。

2.癌症遗传|肿瘤易感基因检测

癌症的发生与发展,是一个外部环境与机体内环境共同作用的结果。肿瘤具有遗传易感性,但不同的基因、不同的肿瘤,这种影响程度大不相同。这种检测目前医学界已经积累了一定的临床数据,对检测数据的解读是癌症是否遗传的核心点。

比如针对女性发病率最高的乳腺癌和卵巢癌,类似遗传性乳腺癌-卵巢癌综合症(HBOC),肿瘤遗传基因主要检测BRCA1/BRCA2基因,其对肿瘤发病的影响是非常巨大。

在不进行临床干预的情况下,携带者中大部分女性最终都会身患癌症。

对于这一类基因,欧美国家的研究非常多,数据库也很丰富,解读和应用也相对成熟。如哪些变异有影响,哪些变异没影响,哪些影响大,哪些影响小。携带者应如何进行预防和早筛的策略等。

虽然中国国内这一领域刚起步,借助了国外现有的一些基础,但已经在建立属于自己的数据库。

肿瘤易感基因检测技术主要是基因测序法和高通量基因测序法(NGS,二代测序/新一代测序)以及基因芯片。以目前的技术水平来说已经很成熟。

肿瘤遗传基因检测的核心在于数据解读

检出有什么变异是不直接产生意义的,变异与疾病的关系才是核心,比如有些变异分析可推测如何影响蛋白功能,但仍需实例验证。而这些检测结果,只能通过对大数据进行解读,变异与疾病的关系越明确、越精确,对受检者来说就越能发现癌症隐患。

广告插播

45岁早筛癌  60岁不患癌
壹人9折 俩人9折再9折|详询百配健康

3、靶向用药基因检测|靶向用药伴随诊断

靶向药物顾名思义是针对特定靶点的药物。这类药物的特点是,疗效显著,副作用较小,对人群具有高度选择性(即特定基因)。通过特定的基因检测筛选最有可能获益的人群,即是靶向用药的伴随诊断。这种伴随诊断经常与药物研发共同开发出来,有充足的临床数据,技术层面和解读层面都比较成熟。

3.1 基因变异检测

在肿瘤中检测基因方向,最核心的技术要求是灵敏度。在组织样本中,会有不同比例肿瘤细胞和正常细胞,而在肿瘤细胞中,突变的细胞也是占据了一定的比例(具体这两个比例是多少,每个样本都不一样),如果技术不够灵敏,可能就会出现发生了突变而检测不出来的情况;而在血液样本中,这种要求就更高,因为使用血液检测肿瘤基因突变,是通过血液当中的游离肿瘤DNA(ctDNA)来检测突变情况,而血液当中绝大部分是正常的基因组DNA(来源于血细胞),ctDNA含量非常不稳定,可能极低。 灵敏度包括两方面的技术,一是提取和富集的技术,二是检测的技术。

基因变异方向检测在中国应用最多的是检测治疗肺癌的EGFR-TKIs基因,其决定是否能使用靶向药AZD9291奥希替尼。(参考阅读:《肺癌基因检测首检1代靶向药可以吃,为什么耐药后二检3代靶向药却不能用?》)EGFR基因突变检测的常用技术包括基因测序法、ARMS-PCR法、HRM-PCR法等。目前检测界主流推荐用是ARMS法,因为很灵敏,特异性好,操作简单。技术难点,应该是使用血液样本检测的技术。

3.2 融合基因检测

使用克唑替尼阿来替尼等治疗肺癌ALK-TKIs的靶向药物,必须检测EML4-ALK融合基因。检测融合基因的技术难点在于是否能够准确发现融合状态(常见融合方式和少见融合方式),以及试剂和操作流程的可靠性、稳定性。 常用的融合基因检测技术包括荧光原位杂交(FISH)、荧光定量PCR法等。目前主流标准是荧光原位杂交(FISH),因为FISH直接而客观。但仍然存在操作复杂、通量低等不足之处。荧光定量PCR更加方便,但只能检出已设计好的融合类型。 

3.3 基因扩增|基因拷贝数变异检测

基因扩增(CNVs)是乳腺癌常用的检测方向,使用抑制乳腺癌anti-HER2的哌柏西利等靶向药前需要检测。HER2基因扩增 CNV检测的常用技术为荧光原位杂交(FISH)。也有使用免疫组织化学方法进行检测,但其测定的并非CNV本身,而是与CNV相关的,蛋白的表达情况。 目前CNV的主流标准是FISH。


4.化疗药物疗效检测

化疗药物是杀伤增殖细胞的药物。这类药物通常通过作用于特定的信号通路杀伤增殖期的肿瘤细胞,另外其在体内的代谢情况也影响到血药浓度,从而影响最终的治疗效果。这类检测目前医学界有充足的临床数据,技术层面和解读层面都很成熟。

4.1 基因表达检测

比如使用铂类药物治疗前需要检测ERCC1基因表达。

基因表达检测的常用技术为荧光定量PCR法。 基因表达检测的技术难点在于判断标准。不同于基因突变或基因融合,是一个定性的结论,有或无,判断基因表达水平的高低,需要一个参考体系,而这一体系在不同的实验室中是不一样的,通常来说,检测样本的基数越大,参考体系越可靠。

4.2 基因多态性检测

使用多种化疗药物ABCB1(MDR1)前需检测基因多态性。

基因多态性检测的常用技术为基因测序法、ARMS-PCR法等。基因多态性和单碱基因突变本质没有什么不同,都是在基因序列上的单个碱基发生改变,差别在于基因多态性要么一半变异,要么全部变异,因此对检测的灵敏度没有什么要求。 


5.基因检测数据解读|用药参考

目前中国国内用于解读基因检测的数据,有些来源于临床数据,有些来源于FDA批准的检测方案数据。

需要说明的是,人种差异不体现在癌症领域,美国白种人和黑种人的数据参考同样可以应用于中国人。人种差异主要是体现在流行病学的差异,而同样的基因变异则会引起同样的结果,这个是没有差异。

基因检测数据解读,价值主要体现在指导治疗和用药推荐上
 
比如A患者通过基因检测发现有某基因个突变,查询数据库已有的病例,发现同样基因突变的B患者使用某种药物,疗效有显著差异。
 
那么A患者通过使用B患者病例中相应的抑制剂,癌细胞敏感的可能性更高,患者延长生存期和提升生存质量的机会更大
 

 科技抗癌 靶点筛药 首检即9折!

二检9折再9折|详询百配健康

赞: (0)
打赏 扫一扫

关于作者

文章数:493 篇邮箱地址:care@100pei.com
生长的力量!

相关

发表评论